单细胞测序服务

淋巴细胞特异性受体一般由两个基因编码的二聚体(Heterodimers,如TCRα/β、TCRδ/γ或IgH/(κ、λ)组成。大多数免疫组库研究数据来自于免疫细胞受体两条链中的一条,因而不能表现单个免疫细胞天然受体链配对的特性。

为了解决这个问题,iR推出iPair单细胞测序服务。 iPair是在单细胞水平对人或小鼠TCRα/β、TCRδ/γ或IgH/(κ、λ)进行测序以及同源性配对等分析的服务。能够在单次实验中获取多个天然受体链的配对信息和功能性信息。我们还提供免费的数据分析iPair Analyzer,包括拼接读取、基因使用、同源配对分析等,将所有信息综合排列于一个操作便捷的界面中。

iPair+iPair+在iPair的基础上增加了三十多个细胞特性基因的测序和分析,例如GATA3、FOXP3、IFNg、IL-2、IL-4、TNFα、perforin等。在同一个反应孔中以极少体积的反应体系同时完成受体链和细胞特性基因的扩增,不仅能发现罕见细胞亚型,还能更好的呈现细胞特性,高效且节约成本。

(1)适用样本类型:

①根据研究者不同实验目的及要求,可选用全血、全血分离出的PBMC和新鲜组织样本,制备成细胞样本进行保存。

②不同样本预处理建议

(2)提交样本要求:

 

(3)样本提交流程

填写iPair样本提交表(irepchina.cn资料中心>表单),填写完毕后提交,并自行打印一份保存。网站上填写完毕的表单自动递交至技术部门,打印的表单运输时与样本一起邮寄。

(4)操作流程

(5)数据分析iPair Analyzer

单细胞高通量测序产生的数据量非常大,如何有效分析和利用这些数据,以获取单细胞水平免疫组库研究所需的关键信息,尤为重要。因此,我们提供iPair Analyzer软件,通过识别不同的条码和索引序列,对单细胞进行分类和定位,并结合reads的频率进行同源性配对分析。将单细胞配对受体链(如α和β链)单独与全部测序数据进行比较,还能够发现可能有意义的受体链配对信息。另外,使用iPair Analyzer软件进行测序数据进行分析,有利于识别感兴趣的受体配体,还能够建立相关靶点的电子列表用于下游克隆和表达相关的研究。

①软件界面和分析模块

提供iPair Analyzer Demo,您可以下载后装载到本地计算机上用于分析数据的检查。使用iPair Analyzer进行数据分析是iPair和iPair+服务的一部分,不提供单独的软件。

服务热线:400-823-5011

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